Juraj Thoma v kauze čelí obvinění ze zneužití pravomoci úřední osoby, za což mu hrozí až desetileté vězení. V roce 2010 podepsal pro město údajně nevýhodný dodatek smlouvy k provozu počítačů, webů a programů na magistrátu se společností Bit Servis. .
Podle policie tím České Budějovice poškodil o několik milionů korun. Primátor Thoma od začátku tvrdí, že je nevinný.
Poprvé policie předala spis na státní zastupitelství předloni v prosinci. Tehdy státní zástupce trestní stíhání Thomy zastavil.
Policie podle něj nepřinesla dostatek důkazů, že se dopustil trestného činu. Kriminalisté se však k případu vrátili a loni v dubnu zahájili stíhání znovu.